Le branhamisme transfère l'autorité ecclésiale de la tradition protestante ou catholique vers la figure de William Branham en tant que prophète de la fin des temps. Branham est compris comme détenant l'autorité révélatrice suprême pour discerner et communiquer la volonté de Dieu pour l'église des derniers jours. Ses sermons, connus collectivement comme « le Message », ont une autorité quasi-scripturaire pour les disciples.

L'autorité de l'église—dans le branhamisme—réside dans la compréhension et la mise en œuvre du Message de Branham. Les institutions ecclésiales historiques et les catéchismes sont vus comme corrompus et supersédés. Cette concentration de l'autorité en une seule figure vivante (ou ses enregistrements préservés) distingue sharply le branhamisme des structures d'autorité protestantes ou catholiques mainstream.