L'Église kimbanguiste affirme la structure trinitaire classique du Père, du Fils, et du Saint-Esprit, mais avec une différence theologique majeure: Simon Kimbangu est identifié avec le Saint-Esprit ou comme son incarnation.

Cette position représente une adaptation africaine unique de la Trinité chrétienne. Plutôt que de concevoir le Saint-Esprit comme une entité éternelle et immatérielle, l'Église kimbanguiste considère Simon Kimbangu, le prophète et fondateur du movement, comme le Saint-Esprit incarné ou comme la manifestation terrestre du Saint-Esprit.

Cette christologie est distinctive et reflète le contexte africain du movement, où les figures prophétiques incarnent souvent la puissance divine. La Trinité kimbanguiste tisse ainsi la figure historique et prophétique de Kimbangu dans la compréhension même de la nature divine.