Les Mennonites affirment la doctrine trinitaire classique de Dieu : un seul Être existant comme Père, Fils et Saint-Esprit — trois personnes coégales et coéternelles. La Confession de Foi Mennonite (1995) de l'Église Mennonite USA et Canada affirme explicitement la foi trinitaire.

L'emphase de la tradition anabaptiste sur le discernement communautaire, la lecture des Écritures et la présence de l'Esprit dans la congrégation rassemblée est intégrée dans un cadre trinitaire : les fins du Père révélées dans l'Écriture, l'exemple du Fils de discipulat coûteux, et la direction de l'Esprit de la communauté.