L'Église syro-malabare affirme que le Saint-Esprit est la troisième personne de la Trinité, qui procède du Père et du Fils (Filioque). La tradition affirme que le Saint-Esprit « doit être adoré et glorifié » selon le Concile de Constantinople I (381) et le Credo Nicéno-Constantinopolitain. Le Saint-Esprit est le principe actif de la sanctification de l'Église et de chaque fidèle.

Dans la tradition liturgique chaldéenne de l'Église syro-malabare, le rôle du Saint-Esprit est mis en avant particulièrement à travers l'épiclèse — l'invocation du Saint-Esprit pendant la Qurbana (Eucharistie) — qui transforme les dons du pain et du vin au corps et au sang du Christ. Les sept dons du Saint-Esprit — sagesse, intelligence, conseil, force, science, piété et crainte de Dieu — et les fruits de l'Esprit — amour, joie, paix, patience, etc. — sont au cœur de la vie spirituelle syro-malabare.

Le Saint-Esprit donne la vie à l'Église et à ses membres, inspire les prophètes et les apôtres, confère des dons charismatiques, et guide le Magistère de l'Église dans l'interprétation de l'Écriture et de la Tradition. L'Esprit sanctifie les fidèles à travers les sacrements et leurs efforts personnels de repentance et de conversion.