L'Église syro-malabare affirme la réalité de l'enfer comme l'état de séparation éternelle de Dieu et de châtiment pour ceux qui meurent en péché mortel sans repentance. L'enfer est compris non pas principalement comme un lieu de tourment physique, mais comme la conséquence de rejeter définitivement la grâce et l'amour de Dieu. Les damnés sont ceux qui ont librement choisi la séparation de Dieu et qui persistent dans ce choix jusqu'à la mort.

L'Église souligne à la fois la justice divine et la miséricorde divine. Dieu ne désire pas la damnation de quiconque et offre sa grâce à tous. Cependant, Dieu respecte la liberté humaine ; ceux qui rejettent définitivement Dieu et refusent sa grâce font face à la conséquence de ce choix : la séparation éternelle de la source de tout bien et de vie. Cette séparation est comprise comme impliquant la souffrance, bien que la nature précise de cette souffrance ne soit pas définie par l'Église.

L'existence de l'enfer est affirmée comme une doctrine nécessaire à la liberté humaine et à la justice divine. Nier l'enfer serait nier que les choix humains ont des conséquences ultimes et saperait la réalité de la responsabilité morale. L'Église, tout en affirmant la réalité de l'enfer, maintient l'espérance dans la miséricorde de Dieu et met en garde contre la présomption concernant l'état final de quiconque.