L'Église syro-malabare affirme un sacerdoce sacramentel distinct du sacerdoce général de tous les croyants. Les prêtres ordonnés sont compris pour posséder une grâce spéciale et une autorité pour offrir le sacrifice de la Messe (l'Eucharistie) et pour administrer les sacrements. L'ordination est l'un des sept sacrements et effectue une marque indélébile sur l'âme (caractère).

Le ministère ordonné dans l'Église syro-malabare comprend les diacres, les prêtres et les évêques. Les diacres sont ordonnés pour assister au service de l'Église, particulièrement dans l'administration des sacrements et le soin des pauvres. Les diacres dans l'Église syro-malabare peuvent être mariés, selon la tradition du christianisme oriental. Les prêtres, qui peuvent également être mariés (selon la pratique chrétienne orientale contrairement à l'Église latine), président les paroisses et offrent l'Eucharistie.

Les évêques sont compris comme les successeurs des apôtres et possèdent la plénitude de l'autorité apostolique. Seuls les évêques peuvent ordonner le nouveau clergé et sont compris comme les gardiens de la foi dans leurs diocèses. Bien que l'Église syro-malabare permette un clergé marié (une distinction significative du célibat exigé de l'Église latine), l'entrée au monachisme et l'acceptation du célibat est honorée comme une vocation plus élevée.