Iglesia ni Cristo rejette l'interprétation traditionnelle de Jean 1:1 selon laquelle Jésus est Dieu (ho theos). Ils interprètent le verset comme enseignant que la Parole (Logos) est divine par nature mais subordonnée à Dieu le Père. L'enseignement officiel de l'INC soutient que Jésus-Christ est le Fils de Dieu, un être divin envoyé par Dieu, mais pas Dieu lui-même.

La Doctrine de l'INC enseigne clairement que la phrase « la Parole était Dieu » est mal interprétée par les églises trinitaires. Leur lecture souligne que « la Parole était auprès de Dieu » (montrant la distinction) et comprend la nature divine de la Parole dans un cadre subordinationniste. Cette interprétation est fondamentale à la christologie de l'INC et à leur théologie non-trinitaire distinctive.