La Science chrétienne rejette l'interprétation catholique et même protestante de Matthieu 16:18. Le rocher (petra) n'est pas Pierre en tant que personne ou fondateur de l'église, ni même l'église hiérarchique. Le rocher est la compréhension de la Vérité spirituelle de Jésus—que Jésus est l'expression du Christ, l'Idée divine.

Sur cette compréhension spirituelle—que Christ est l'Idée de Dieu transcendant la personnalité humaine—l'église véritable est construite. Cette interprétation situe l'autorité dans la Vérité divine elle-même, non dans une succession apostolique ou une structure hiérarchique. L'église est la communion de tous ceux qui reconnaissent et pratiquent le Principe divin.