L'Église assyrienne de l'Orient affirme pleinement la doctrine du Saint-Esprit comme composante fondamentale de la foi apostolique. Dieu est une essence divine unique (ituta) subsistant en trois personnes distinctes (qnomes) — le Père, le Fils et le Saint-Esprit. Cette formulation, utilisant la terminologie théologique syriaque, exprime la même vérité que l'homoousios grec de Nicée, tout en conservant le cadre linguistique et conceptuel distinctif de la tradition théologique syro-orientale.

L'Église a reconnu le Concile de Nicée (325 ap. J.-C.) et le Concile de Constantinople (381 ap. J.-C.) comme des conciles œcuméniques valides et maintient leurs définitions trinitaires. Cependant, l'Église a rejeté le Concile d'Éphèse (431 ap. J.-C.) parce qu'il a condamné Nestorius, dont la méthode christologique était valorisée par la tradition syro-orientale. La terminologie syriaque reflète l'indépendance théologique de l'Église vis-à-vis de la chrétienté grecophone, avec qnomes désignant les hypostases distinctes et parsopa désignant la personne unique et unifiée du Christ.