L'Église syro-malabare enseigne que chaque personne possède une âme immortelle créée à l'image de Dieu. À la mort, l'âme se sépare du corps et subit un jugement particulier déterminant son état initial dans l'au-delà. La tradition affirme que les justes entrent dans un état de repos et de paix, tandis que les impénitents font face au jugement et à la séparation de Dieu. L'eschatologie inclut l'attente de la résurrection générale et du jugement final.

Comme dans la tradition catholique orientale, l'Église syro-malabare affirme l'intercession pour les morts et le pouvoir de la prière et des sacrements à bénéficier les défunts. La communauté des vivants et des morts dans l'Église est maintenue par la prière commune, particulièrement pendant la Divine Liturgie. La résurrection corporelle est affirmée comme doctrine centrale, non pas comme simple restauration du corps mais comme glorification et transformation du corps en union avec la bénédiction éternelle. Les sacrements terrestres sont considérés comme des signes qui pointent vers et participent à la réalité eschatologique à venir.