L'Église syro-malabare enseigne la prédestination selon le cadre synergique affirmé au Concile de Trente. Dieu prédestine les élus, mais cette prédestination n'est pas arbitraire ni indépendante de la foi et de la coopération prévues. La prescience de Dieu inclut la connaissance de la manière dont chaque personne répondra à la grâce divine, et la volonté prédestinante de Dieu tient ceci en compte.

Cette vue, influencée par la théologie de Luis de Molina (molininisme), cherche à préserver à la fois la souveraineté divine et le libre arbitre humain. Dieu ne crée pas certaines personnes à la damnation ; plutôt, Dieu désire le salut de tous. Cependant, certains résistent à la grâce de Dieu et finissent par rejeter le salut, pour lequel ils portent la responsabilité. La grâce de Dieu est vraiment efficace — elle produit l'effet désiré — mais elle fonctionne à travers la liberté humaine, non contre elle.

La double prédestination (la prédestination de certains à la damnation et d'autres au salut) est explicitement rejetée. L'Église enseigne que Dieu fournit une grâce suffisante à tous pour le salut, bien que certains rejettent cette grâce. Les anathèmes du Concile de Trente condamnent à la fois une vue pélagienne qui nie la grâce de Dieu et une vue calviniste qui nie la responsabilité humaine. L'Église syro-malabare suit ce chemin du milieu.