L'Église syro-malabare, suivant la tradition catholique universelle, baptise « au nom du Père et du Fils et du Saint-Esprit » selon la formule mandatée par Matthieu 28:19. Certaines traditions de l'Église primitive baptisaient « au nom de Jésus » seul (Actes), mais l'Église catholique affirme que cette pratique est compatible avec la formule trinitaire plus développée du Matthieu.

La formule trinitaire est considérée comme la formule complète et autorisée pour le baptême. Elle manifeste l'ensemble de la docrine de la Trinité et la nature trinitaire du baptême sacramentel. L'Église syro-malabare utilise la formule trinitaire dans sa liturgie baptismale et la considère comme essentielle à la validité du sacrement.