Les Assemblées de Dieu, en accord avec la Réforme protestante, rejettent les livres deutérocanoniques (Tobit, Judith, Sagesse, Sirach, Baruch, Lettres de Jérémie, 1-2 Maccabées) comme non-inspirés et non-canoniques. Ces livres sont inclus dans la Septante (la traduction grecque de l'Ancien Testament) et dans le Canon romain, mais ne figurent pas dans le Canon hébraïque et ne sont pas reconnus par la plupart des traditions protestantes.

Bien que les Assemblées reconnaissent que ces livres sont historiquement intéressants et qu'ils contiennent occasionnellement des enseignements moraux utiles, ils ne portent pas l'autorité de l'Écriture sainte et ne doivent pas être utilisés pour établir la doctrine. Les Assemblées distinguent clairement entre l'Écriture sainte (la parole inspirée de Dieu, entièrement autoritaire) et les écrits ecclésiastiques utiles (qui peuvent édifier mais ne normalisent pas la foi).

Les Assemblées insistent donc sur le Canon 66-livres (protestant) plutôt que sur le Canon catholique-romain de 73 livres, reflétant une conviction que l'Écriture seule (sola scriptura) constitue la norme normans pour la foi et la pratique chrétienne.