Le pentecôtisme d'Unicité affirme que la plus haute autorité ecclésiale réside dans les Saintes Écritures. L'Église fonctionne par une structure de gouvernance locale fortement autonome : chaque assemblée locale élisait ses pasteurs et anciens et prend les décisions concernant la doctrine et la pratique sous la direction du Saint-Esprit. Il n'existe pas de hiérarchie internationale centralisée équivalente à celle des catholiques ou des orthodoxes.

L'Unicité affirme une ecclésiologie apostolique — l'Église du Seigneur est composée de croyants nés de nouveau remplis du Saint-Esprit, dispersés dans des assemblées locales. L'ordre apostolique établi dans le Nouveau Testament — pasteurs, anciens, et diacres responsables devant leurs congrégations — est le modèle normatif pour l'Église aujourd'hui.