Le WELS affirme que l'autorité de l'Église dérive de l'Écriture sainte. L'Écriture seule est l'autorité finale dans les questions de foi et de doctrine. Aucun concile d'église, aucun magistère, aucune tradition ne peut se placer au-dessus de la Parole écrite de Dieu. Tout ce que l'Église enseigne doit être fondé sur et en conformité avec l'Écriture.

Cependant, le WELS reconnaît que l'Église a une responsabilité de préserver et de transmettre l'enseignement apostolique fidèlement. Les confessions luthériennes — Augsbourg, Formule de Concorde et autres — ne sont pas infaillibles mais sont reconnues comme des explicitations fiables de l'enseignement scripturaire. L'Église se réunit régulièrement en synode pour délibérer sur les questions doctrinales à la lumière de l'Écriture.

Le WELS enseigne que les pasteurs ont autorité pour absoudre les péchés au nom du Christ, pour exorciser, et pour prêcher la Parole. Cependant, cette autorité est délimitée par l'Écriture et par la compréhension confessionnelle de la Parole. Le pasteur est serviteur de la Parole, non seigneur sur elle. Le WELS maintient des principes de discipline ecclésiale et d'exclusion de ceux qui s'opposent à la doctrine établie.