L'Iglesia ni Cristo n'accepte pas le Pasteur d'Hermas comme faisant partie du canon biblique. Bien que ce soit un texte chrétien primitif avec une certaine valeur historique, il manque de l'autorité apostolique et a été justement exclu du canon par l'Église primitive. L'ouvrage n'a jamais été considéré comme apostolique et manque de l'autorité divine caractéristique de l'Écriture canonique.

L'Iglesia ni Cristo distingue entre l'Écriture (le canon de 66 livres) et d'autres écrits chrétiens, aussi précieux soient-ils. Le Pasteur d'Hermas peut être étudié historiquement mais n'a pas d'autorité obligatoire pour la doctrine ou la pratique. Le témoignage apostolique dans les 66 livres est suprême.