Les Baptistes du libre arbitre affirment que Jésus-Christ, comme le Fils éternel de Dieu, a préexisté avant son incarnation. Le Traité de la Foi affirme l'éternité du Christ et son rôle comme Fils divin par qui Dieu a créé toutes choses. Le Verbe (Logos) identifié dans Jean 1:1–3 avec Jésus révèle que la personne historique qui a marché sur la terre est le même être divin éternel qui existait « au commencement » avec Dieu.

La filiation éternelle distingue la position des Baptistes du libre arbitre de l'adoptianisme (la vue que Jésus est devenu le Fils de Dieu seulement à son baptême ou sa résurrection). La préexistence du Christ est affirmée comme essentielle à la compréhension de son identité et de son œuvre rédemptrice. C'est le Fils éternel de Dieu qui s'est incarné, est mort et ressuscité pour le salut de l'humanité.

La préexistence du Christ fonde aussi l'universalité de la rédemption dans la théologie des Baptistes du libre arbitre. Parce que le Christ est le Fils éternel de Dieu, sa mort est d'une valeur infinie, suffisante pour expier les péchés de toute l'humanité. Bien que tous ne seront pas sauvés (seulement ceux qui croient), l'expiation est universelle dans sa portée — offerte à tous parce que c'est le Fils de Dieu qui est mort.