Les Baptistes du libre arbitre affirment la compréhension théiste classique de Dieu. Dieu est éternel, infini, omnipotent (tout-puissant), omniscient (qui sait tout), omniprésent (partout), et absolument saint et juste. Dieu est le Créateur et Soutien de toutes choses et ne dépend pas de la création pour son existence. Dieu est un Être personnel qui connaît, aime et agit dans l'histoire, effectuant la rédemption et le jugement.

Un accent distinctif de la théologie des Baptistes du libre arbitre est l'équilibre entre la justice de Dieu et l'amour de Dieu. Tandis que Dieu est absolument juste et saint, exigeant l'obéissance parfaite et punissant le péché, Dieu est également caractérisé par l'amour, la miséricorde et la compassion. Cet équilibre façonne la compréhension des Baptistes du libre arbitre du salut : la justice de Dieu exige une réponse au péché, mais l'amour de Dieu procure la grâce et l'opportunité pour tous de répondre à l'Évangile par la grâce prévenante.

Les Baptistes du libre arbitre affirment la prescience divine des événements futurs tout en maintenant que cette prescience ne détermine pas les choix humains. Dieu sait ce qui se passera parce que la connaissance de Dieu est parfaite, mais cela ne rend pas les événements nécessaires ni n'enlève la responsabilité humaine. Cette position (souvent appelée « compatibilisme théologique » ou « connaissance médiane » dans les cercles des Baptistes du libre arbitre) vise à préserver à la fois l'omniscience divine et le libre arbitre humain.