Matthieu 28:19 enregistre la Grande Commission où Jésus commande ses disciples : « Allez donc et faites disciples de toutes les nations, les baptisant au nom du Père, du Fils et du Saint-Esprit. » L'EFCA interprète ce verset comme instituant une formule trinitaire pour administrer le baptême.

Cette formule trinitaire — « au nom du Père, du Fils et du Saint-Esprit » — est compris par l'EFCA comme une affirmation de la Trinité et de l'importance baptismale de chaque personne de la Trinité. Le baptême au nom de la Trinité affirme que le baptisé entre dans la relation à tous les trois — soumis au Père, racheté par le Fils, et scellé par le Saint-Esprit.

Bien que certains groupes non-trinitaires ou modaux rejettent la formule trinitaire en faveur du baptême « au nom de Jésus seul », l'EFCA affirme que Matthieu 28:19 établit clairement une formule trinitaire. Cette compréhension est cohérente avec la théologie trinitaire classique de l'Église et reflète la compréhension de la majorité des traditions chrétiennes à travers l'histoire. L'EFCA applique ce passage pour soutenir à la fois la réalité de la Trinité et l'importance d'administrer le baptême correctement selon l'institution de Christ.