Jésus-Christ, le Fils de Dieu fait chair, est le centre de la foi chrétienne copte. L'Église copte-orthodoxe confesse que le Verbe éternel du Père s'est incarné, assumant une nature humaine complète (corps, âme et esprit) pour l'union hypostatique avec sa nature divine. Il n'y a qu'une seule nature incarnée du Verbe (mia physis), comme l'a enseigné Saint Cyrille d'Alexandrie et le concile de Calcédoine l'a implicitement reconnu.

Le Christ est vrai Dieu et vrai Homme, conçu miraculeusement par le Saint-Esprit et né de la Vierge Marie. Il a souffert, est mort et ressuscité pour notre salut. L'Incarnation est la manifestation définitive du Logos divin et le moyen par lequel Dieu guérit l'humanité de ses blessures. Saint Athanase a exprimé la conviction centrale copte : « Dieu s'est fait humain pour que l'homme devienne Dieu. » Le Christ ressuscité et ascensionné siège à la droite du Père et intercède continuellement pour nous.