L'Église copte-orthodoxe affirme la compréhension chrétienne classique de Dieu : unique, infini, éternel, tout-puissant, omniscient, parfaitement bon et créateur de toutes choses. La tradition théologique alexandrine, qui a profondément façonné la théologie copte, souligne à la fois la transcendance radicale de Dieu (théologie apophatique) et l'auto-communication véritable de Dieu par le Logos et le Saint-Esprit. L'infinité et l'incompréhensibilité de Dieu sont maintenues parallèlement à la conviction chrétienne que Dieu est personnel et activement présent dans la création.

Un accent caractéristique de la théologie copte est sur l'amour et la miséricorde de Dieu. La prédication et la spiritualité copte reviennent fréquemment au thème selon lequel Dieu est fondamentalement un Dieu d'amour qui ne désire pas la mort du pécheur mais sa repentance et sa guérison. Cela façonne les approches coptes de la sotériologie, de l'eschatologie et de la compréhension de la croix. Les prières coptes quotidiennes de l'Agpeya commencent par la reconnaissance de la grandeur et de la miséricorde de Dieu.