La Science chrétienne rejette la prédestination calviniste. Elle enseigne que Dieu, en tant que Principe divin, ne prédétermine pas l'avenir ou le destin des individus. Au lieu de cela, chaque personne a la capacité à comprendre et à démontrer la Vérité divine à travers la Science chrétienne.

Le libre arbitre n'est pas conditionné par un décret éternel de Dieu, mais est l'expression de la liberté spirituelle. Dieu ne crée pas le mal et ne le permet pas pour ses propres fins ; ainsi, il ne peut pas prédestiner certains à la damnation. Cette compréhension place l'accent sur la responsabilité individuelle et le progrès spirituel continu.