Le branhamisme enseigne que le Saint-Esprit n'est pas une personne séparée, mais plutôt la présence du Christ agissant dans et par les croyants. Le Saint-Esprit est la puissance opérationnelle du seul Dieu (Jésus) habitant en nous et sanctifiant les croyants. Le parler en langues est considéré comme la preuve initiale et le signe continu de la présence et du baptême du Saint-Esprit.

Cette doctrine découle de la théologie de l'Unicité : puisque Dieu est une seule personne (Jésus), le Saint-Esprit ne peut pas être une troisième personne distincte. Au lieu de cela, c'est la présence active de Dieu, son souffle et sa puissance accordés à l'église. Branham a souligné que le baptême du Saint-Esprit, attesté par la glossolalie, est essentiel au salut et marque les véritables croyants. La réception du Saint-Esprit est inséparable de l'acceptation du Message et du ministère révélatoire de Branham.