Les Unitariens bibliques adoptent diverses positions sur le service militaire, reflet de la diversité au sein du mouvement. Certains Unitariens bibliques, particulièrement ceux dans les traditions anabaptistes ou pacifistes, s'opposent au service militaire et au meurtre justifié par la guerre, s'appuyant sur les enseignements de Jésus sur l'amour des ennemis et sur le refus de la violence. Pour ces groupes, le service militaire est vu comme incompatible avec un engagement éthique à la non-violence.

D'autres Unitariens bibliques, cependant, acceptent le service militaire comme moralement permissible dans le contexte d'une auto-défense nationale justifiée ou d'une guerre juste. Ils soutiennent que le gouvernement a l'autorité de maintenir l'ordre et la justice à travers les forces militaires, et qu'un citoyen peut participer en bonne conscience à cette fonction gouvernementale.

La conscience individuelle et le discernement pastoral jouent un rôle central dans cette question pour les Unitariens bibliques. Le mouvement ne impose généralement pas une position unique sur le service militaire ; plutôt, il existe un respect pour les convictions variées des croyants individuels sur cette question complexe. Ceux qui choisissent de ne pas servir sont généralement respectés comme le font ceux qui choisissent de servir.