L'Église assyrienne de l'Orient enseigne que chaque personne possède une âme immortelle créée à l'image de Dieu. À la mort, l'âme se sépare du corps et subit un jugement particulier, dans lequel l'âme est jugée individuellement devant Dieu. L'état intermédiaire — la période entre la mort et la résurrection finale — implique une existence consciente soit dans un état de bénédiction, soit en séparation de Dieu, bien que la nature précise de l'état intermédiaire ne soit pas développée dans l'enseignement de l'Église.

L'Église affirme la doctrine de la résurrection corporelle au Dernier Jour, quand toutes les âmes seront réunies à leurs corps dans la résurrection générale. Ceci est une doctrine fondamentale maintenue depuis la tradition apostolique et exprimée dans les anciennes liturgies. L'Église enseigne la communion des saints, et des prières pour les défunts sont offertes dans la Divine Liturgie, exprimant la conviction que l'Église vivante reste en communion spirituelle avec ceux qui sont décédés et que la prière intercessoire soutient les défunts.