La tradition vaudoise affirme le canon protestant et rejette les livres deutérocanoniques comme non-canoniques. Les Vaudois suivent le principe que seuls les livres ayant l'autorité apostolique et la reconnaissance universelle précoce se qualifient comme l'Écriture.

Les livres deutérocanoniques échouent ces tests : ils ne sont pas cités dans le Nouveau Testament comme l'Écriture, n'ont pas été universellement acceptés dans l'Église primitive (de nombreux Pères de l'Église ont remis en question leur statut), et manquent d'origine apostolique directe. L'engagement vaudoise envers l'autorité biblique et la suffisance de l'Écriture (sola scriptura) nécessite de maintenir les limites du canon authentique.

Les Vaudois notent que l'inclusion des livres deutérocanoniques dans le canon catholique est un développement ultérieur (formellement défini au Concile de Trente en 1546) et représente un départ de la pratique de l'Église primitive et de la tradition hébraïque. La position vaudoise maintient la continuité avec l'Église primitive et la tradition juive.