Les Baptistes réformés affirment la légitimité du service militaire et de l'autodéfense armée. Contrairement aux anabaptistes, ils n'enseignent pas le pacifisme absolu mais affirment la théorie de la guerre juste.

Le gouvernement civil a le droit d'utiliser la force pour maintenir l'ordre et protéger les innocents. Les citoyens peuvent servir honorablement dans les forces armées. Cependant, la participation au service militaire reste une affaire de conscience chrétienne personnelle.