La grande majorité des églises évangéliques non-dénominales affirment l'orthodoxie trinitaire : un Dieu qui existe éternellement en trois personnes coéternelles et coégales — le Père, le Fils et l'Esprit Saint. La plupart des documents de déclaration de foi des églises évangéliques non-dénominales confessent explicitement la Trinité comme une doctrine fondamentale, non-négociable. Beaucoup s'inspirent des confessions évangéliques historiques ou produisent leurs propres déclarations locales qui reflètent les affirmations trinitaires du Credo de Nicée.

Parce que l'évangélicalisme non-dénominationnel n'est pas régi par un seul organisme confessionnel, il n'existe pas de document unique faisant autorité. Cependant, les sondages généralisés des documents de déclaration de foi des églises non-dénominales (compilés par des chercheurs associés à la National Association of Evangelicals ou au Pew Research Center) montrent une affirmation trinitaire quasi-universelle. La Trinité est généralement présentée comme le point de départ de toute autre doctrine.

Une petite minorité de congrégations qui s'identifient comme « non-dénominales » ou « interconfessionnelles » peuvent tenir des positions non-trinitaires (p. ex., théologie de l'Unité, modalisme), mais ces cas représentent des exceptions plutôt que le courant dominant du mouvement. L'église évangélique non-dénominale typique aux États-Unis affirme la doctrine trinitaire classique.