L'Église néo-apostolique affirme une compréhension traditionnelle de la nature de Dieu en tant que Père trinitaire. Dieu est présenté comme le Dieu de la grâce, de l'amour, et du but rédempteur. Ces attributs divins sont centraux à la théologie et à la pratique de l'Église.

Dieu n'est pas conçu en termes abstraits ou philosophiques mais en tant que Père personnel et aimant qui s'investit dans la rédemption de l'humanité. L'amour divin est la force motrice de la création, de l'incarnation, et du salut.

Le Dieu de la théologie néo-apostolique est à la fois transcendant et immanent: majestueux et saint, mais aussi accessible et bienveillant envers les croyants fidèles.