Le WELS enseigne que l'engagement militaire n'est pas moralement interdit aux chrétiens. Les croyants peuvent consciemment servir dans les forces armées d'une nation juste pour une cause juste, à condition que la guerre soit entreprise de manière justifiée selon le droit naturel et la raison morale.

Cependant, le WELS observe que certains chrétiens peuvent en bonne conscience se sentir appelés à un chemin non violent ou au refus du service militaire. Bien que le Synode n'impose pas obligatoirement le pacifisme à tous les membres, il reconnaît que les objections de conscience sincères doivent être respectées. Le WELS maintient que la loyauté chrétienne première est envers le Christ et son Royaume, non envers l'État ou les pouvoirs terrestres.

Notably, le WELS a traditionnellement refusé la participation officielle aux chapelaincies militaires, maintenant une position séparatiste forte concernant la relation de l'Église à l'État. Cependant, les pasteurs du WELS peuvent servir comme conseillers spirituels individuels aux militaires croyants. Le WELS encourage les chrétiens à rechercher la paix et à soutenir la justice, tout en reconnaissant que vivre pacifiquement dans un monde déchu exige parfois de prendre des décisions difficiles.