Le congrégationalisme n'a pas adopté une position systématique pacifiste (pacifisme) comparée à celle des Mennonites ou des Amish. Alors que le congrégationalisme historique était souvent antiautoritaire dans sa polité — récusant la domination des seigneurs ecclésiastiques — il n'a pas systématiquement rejeté la légitime défense de l'État ou la participation au service militaire.

Dans l'histoire américaine, les congrégations congrégationalistes ont inclus à la fois ceux qui se sont engagés dans le service militaire et ceux qui ont pris des positions pacifistes. Pendant la Révolution américaine, les congrégationalistes étaient divisés, avec certains ministres soutenant la révolution et d'autres maintenant une neutralité ou une opposition. Pendant la Guerre de Sécession, les congrégationalistes du Nord se sont largement identifiés à la cause abolitionniste et à l'effort de guerre.

L'Église unie du Christ contemporaine n'impose pas une obligation uniforme de participation militaire ni une obligation uniforme de non-violence. L'UCC reconnaît que sur les questions de justice, de paix, et d'ordre public, les croyants peuvent en conscience arriver à des conclusions différentes. Cependant, l'UCC, comme corps historique, a souvent exprimé sa préoccupation pour les guerres injustes et a plaidé pour des solutions non-violentes aux conflits. L'autonomie congrégationaliste signifie que les congrégations et les croyants individuels peuvent discerner différemment leur responsabilité envers l'ordre public et la justice globale.