L'Église du Nazaréen enseigne un ordo salutis en deux étapes (ordre du salut) enraciné dans la théologie de Jean Wesley. La première étape est le salut initial : la justification (pardon des péchés) et la régénération (nouvelle naissance) reçues par la repentance et la foi en Jésus-Christ. C'est le point d'entrée dans la vie chrétienne et s'accompllit entièrement par la grâce de Dieu, non par le mérite humain.

La deuxième étape est la sanctification entière (aussi appelée « amour parfait » ou la « deuxième bénédiction ») — une expérience de crise ultérieure à la conversion dans laquelle le Saint-Esprit purifie le cœur de sa tendance pécheresse (le « péché interne » ou la « nature charnelle ») et remplit le croyant d'amour parfait pour Dieu et le prochain. Cela ne signifie pas une perfection sans péché au sens d'une liberté absolue de toute erreur involontaire ou infirmité, mais cela signifie la liberté du péché délibéré et connu et de la disposition racine de l'auto-volonté opposée à Dieu.

Cette doctrine est la particularité théologique de l'Église du Nazaréen et de la tradition plus large de la sainteté wesleyenne. Elle s'appuie sur la lecture par Wesley de textes tels que Matthieu 5:48, 1 Jean 4:17-18 et Hébreux 10:14, et elle façonne tous les aspects de la spiritualité, de la prédication et de l'enseignement moral nazaréens. La dénomination affirme que cette expérience de la sanctification entière est offerte à tous les croyants et doit être recherchée avec zèle.