L'Église des Frères est une église historique de paix : elle affirme la doctrine de la non-résistance. Les croyants ne doivent pas participer à la guerre, à la violence militaire, ou à la prise d'armes meurtriers, même pour une « juste cause ».

Cette position repose sur l'enseignement de Jésus dans le Sermon sur la montagne (Matthieu 5:38-48 ; Luc 6:27-36) : « Aimez vos ennemis, bénissez ceux qui vous maudissent, rendez le bien pour le mal. » Le Christ a refusé la force violente et a exhorté ses disciples à prendre la croix plutôt que l'épée.

L'Église encourage ses membres à servir en tant qu'objecteurs de conscience, à rechercher un service civil alternatif plutôt que de servir dans l'armée. Cette position provient de la Confession de Dordrecht (1632) et des traditions théologiques des Anabaptistes. L'Église des Frères maintient que le Royaume de Dieu ne peut pas être établi par la force militaire mais par l'amour, le pardon, la justice et la non-violence. Les Frères prient pour la paix et travaillent pour la justice, tout en refusant de prendre les armes.