Les Freres en Christ affirment le canon protestant de 39 livres de l'Ancien Testament et 27 livres du Nouveau Testament, rejetant les livres deuterocanonicxes (Tobit, Sagesse, Siracide, Baruch, Maccabees) comme l'Ecriture. Bien que ces textes soient valorises comme sources historiques pour comprendre le judaisme du Second Temple et le christianisme primitif, ils ne portent pas l'autorite apostolique ou le poids canonique dans la doctrine FEC.

La tradition anabaptiste, enracinnee dans les principes de la Reformation, affirme la sola scriptura—l'Ecriture seule. Les livres deuterocanonicxes sont lus pour l'edification et le contexte historique mais non comme contraignant pour la doctrine ou la pratique. Les FEC reconnaissent leur valeur tout en maintenant le canon protestant ferme comme la parole autorisante de Dieu.