Les Baptistes du sud rejettent les livres deutérocanoniques (Tobit, Wisdom, Sirach [Ecclésiastique], 1-2 Maccabées) comme non-canoniques. Bien que ces livres aient été inclus dans la Vulgate latine et soient reconnus par l'Église catholique romaine et l'Église orthodoxe, ils ne sont pas acceptés comme faisant pleinement autorité par les Protestants.

Les arguments historiques et littéraires pour rejeter ces livres comprennent : ils ont été écrits en grec ou en hébreu tardif après l'époque prophétique, ils ne sont pas cités par Jésus ou les apôtres, et l'Église judaïque primitive ne les considérait pas comme de l'Écriture Sainte. Bien que les Baptistes du sud reconnaissent leur valeur historique et spirituelle, ils ne les placent pas au même niveau d'autorité que les soixante-six livres canoniques.